45. Формування локальної структури при моделюванні двох малих білків
Guha Jayachandran, V. Vishal, Angel E. Garcia and V. S. Pande. Journal of Structural Biology, (2006)
Розпаралелені всеатомні обчислення молекулярної динаміки використовувалися для дослідження формування та існування локальної структури двох малих альфа-спіральних білків. Ми повідомляємо про існування перехідних спіралей і комбінацій спіралей у розгорнутому ансамблі [стані, що передує згортанню білків], а також наявності певного порядку формування спіралей, що в значній мірі погоджується з попередніми експериментальними результатами. Перехідна локальна структура спостерігається навіть в умовах відсутності повної природної структури. Ми також розраховуємо набори пар залишків-залишків (residue-residue), на підставі статистичного прогнозування формування заданих локальних структур у наших симуляціях.
Переклад з англ. здійснив Rilian
|