45. Формирование локальной структуры при моделировании двух малых белков
Guha Jayachandran, V. Vishal, Angel E. Garcia and V. S. Pande. Journal of Structural Biology, (2006)
Распараллеленные всеатомные вычисления молекулярной динамики использовались для исследования формирования и существования локальной структуры двух малых альфа-спиральных белков. Мы сообщаем о существовании переходных спиралей и комбинаций спиралей в развернутом ансамбле [состоянии, предшествующем сворачиванию белков], а также наличии определенного порядка формирования спиралей, что в значительной степени согласуется с предыдущими экспериментальными результатами. Переходная локальная структура наблюдается даже в условиях отсутствия полной естественной структуры. Мы также рассчитываем наборы пар остатков-остатков (residue-residue), на основании статистического прогнозирования формирования заданных локальных структур в наших симуляциях.
Перевод с англ. выполнил Rilian
|