40. Электрические поля и активное состояние энзимов: прямое сравнение эксперимента с теорией
Авторы: Ian T. Suydam, Christopher D. Snow, Vijay S. Pande, Steven G. Boxer. Science (2006)
Итоги: Возможность количественной оценки электрических полей в протеинах является важной задачей. В этой статье, благодаря распределенным вычислениям проекта Folding@Home, мы сопоставляем новые экспериментальные методы с новыми теоретическими методами. В частности, мы считаем, что изучение отдельных структур не является эффективным в плане исследования электростатики в белках, поэтому предполагаем, что множественные подходы в Folding@Home сыграют важную роль в изучении данной проблемы.
Немного теории: Электрическое поле, образующееся в свернувшихся белках влияет почти на каждый аспект их функциональности. Мы представляем вибрационно-спектроскопическую технику, которая измеряет изменения в электрическом поле при определенном положении белка как перепады частоты (сильные сдвиги) калиброванной нитриловой вибрации. Нитрил-содержащий ингибитор используется для доставки уникального колебания в активную часть человеческой альдозредуктазы, и отклик нитриловой частоты измеряется серией мутаций на участке с активным энзимом. Эти сдвиги предоставляют количественную информацию об электрических полях, которые можно прямо сравнивать с электростатическими вычислениями. Мы показали, что необходима симуляция экстенсивной молекулярной динамики и множество усреднений, чтобы воспроизвести наблюдаемые изменения в поле.
Более подробную информацию можете получить из данного PDF-документа.
|