Distributed Computing team of Ukraine | Ukraine - Українська Команда Розподілених Обчислень | Ukraine - Украинская Команда Распределённых Вычислений - Описи проектівhttps://distributed.org.ua/index.php?go=Pages&in=view&id=49 |
Распечатать |
Проекты 2400-2420
Проекты 2400-2420
Проекты серии 24хх исследуют химическое окружение рибосомного туннеля.
Рибосома - наиболее важный естественный энзим, выполняющий функцию формирования новых белков. Рибосома - это "фабрика", где "рецепт", зашифрованный в ДНК, считывается и переводится в набор инструкций, которые будут использованы для сборки белков, регулирующих жизненные циклы всех живых клеток.
Горизонтальный срез туннеля рибосомы (черным обозначены места внутри туннеля, где будет опробировано сродство) (с) изображение fah-web.stanford.edu
Рибосома - сложное молекулярное устройство, состоящее из нескольких компонентов, синхронизированных во времени, которые обеспечивают синтез и регулирование белков, покидающих клетки в виде цепочек полипептидов через исходящий рибосомный туннель.
Как и в любой специализированной биологической "машине", функционирование рибосомы может быть нарушено, и, в конце концов, остановлено разными агентами, некоторые из которых нацелены на механические действия, нарушения химических взаимодействий, вызывающие смерть клетки. Например, некоторые антибиотики и др. малые молекулы прикрепляются к важным участкам исходящего туннеля и могут блокировать рибосомы.
Внутренняя поверхность туннеля рибосомы и малые молекулы, которые могут прикрепляться во время симуляций (с) изображение fah-web.stanford.edu
В то же время, чувствительность исходящего туннеля рибосомы такова, что некоторые последовательности аминокислот проводят больше времени в туннеле, что вызывает замедленный синтез и регулировку этих особенных белков.
Цель проекта - исследовать химическую среду внутри исходящего туннеля рибосомы, и его сродство в отношении некоторых малых молекул. Для этих целей мы планируем испытать различные участки туннеля разными библиотеками малых молекул.
| 23.01.2007 10:51